mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCGGACCAGGCTTCATTCCCC GGATTGCTGTCTGGTTCGATG TAACTGTTGAGGGGATTGCTGTCTGGTTCGATGTCATTCATGTGAAGCTTTAACATTAATGTAGTATTGAGTGATTTCGGACCAGGCTTCATTCCCCCCAACTATA 3 0 3' arm Populus_trichocarpa pmrd mir-166 6e-49 ptc-MIR166b 2e-55 -47 .....((((.(((((.((..(((((((((((.((((((((.(((..((.(((....))).))..))))))))))).)))))))))))..)).))))).)))).... (-47.00)