mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCGGACCAGGCTTCATTCCCC GGATTGTCGTCTGGTTCGATG TAACTGTTGAGGGGATTGTCGTCTGGTTCGATGTCATTCATGAGAAGCTCAAACATAAACGTAATATTGAATGATTTCGGACCAGGCTTCATTCCCCCCAACAATG 3 0 3' arm Populus_trichocarpa pmrd mir-166 2e-27 ptc-MIR166e 2e-55 -47.2 ....(((((.(((((.((..(((((((((((.((((((((.(((...)))..((......)).....)))))))).)))))))))))..)).))))).)))))... (-47.20)