mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ACAGCAGGCACAGACAGGCAG GCCTGTCTACACTTGCTGTGC GAGTTGTCATGTGTCTGCCTGTCTACACTTGCTGTGCAGAACATCCGCTCACCTGTACAGCAGGCACAGACAGGCAGTCACATGACAACC TGGTTTGATTACTTTGAATTCTGACTGCATGAGGGCCAGTAACAACAGGAACTGGATTTTAAAAGTTTATGTTGTTATTTTTTTTCCTTAAAATCATGTGAATTTTCTGTTTTTGACAATTATCCTTGTTAGCAACATTTGGATCAAATGTATGAGTGTACTTCTGAATAAAGCCAAACGTCTAACTTCTTTTTAGTTCCATAATGTTTTAATGTTTAATTCTATTGTGTGTTTCTCTCCTTTCCCTTTATCCCCCTGTCCTTCCCCCCTAAATCACCAAATCTGGAAAACAGGCTGATTGTATCTGTCCCTGAGCAAAGGAAACCTGAAGGACCCAAGGGCCTGGCTGGACAGAGTTGTCATGTGTCTGCCTGTCTACACTTGCTGTGCAGAACATCCGCTCACCTGTACAGCAGGCACAGACAGGCAGTCACATGACAACCCAGCCTGAATGACCACCAGCCATTGAAAGAAAGCTGCCCTCACAACATAGCATCTACACCAAGAGCTACAACCACAGTGAGGGGGTTGGGGGGCCTGGGGTTTGAAACTGTTGGCTTATTAAAAGAAAAACTCGTATGTAATCCTTTGATTTTTTTTTGATTCGCATATTAAAACCTACCCGAAGTAAAGTGAGTGGTGCCTATGAAGCCTAATAAAGCCCATTTCTGGAAATTGGAANNNNNNNNNNNACTNAANTATTNNTGTCTCATTTCCTCACCTCCTCCTACTAACATTATATTTAGCGTAACGAAAAATCAGGGGGGGACCCCCTTTTTTTTTGATCCCCTGCGGGGGCCCCAAAATGAGATCTCGATTCGCGCCCAATTGTCTTTAAAAAGTGACTCCCTTATGTGGGCCTAGCATTGGTAGCATTCCGCTCTCCTATGTTGTAAATGTGGTAGGGGCGCCCCTCTATGTGTAGATATACGAGGAGCGGGCCGGGTTATTTAATGGCTTAGATCTTTTCTTTTTTTTAG 3 0 3' arm Mus_musculus mirnest mir-214 2e-42 cfa-mir-214 4e-46 -49.3 ..(((((((((((.((((((((((...((((((((((((.............))))))))))))...)))))))))).))))))))))). (-49.3)