mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCGGACCAGGCTTCATTCCCC GGAATGCTGTCTGGTTCGAGA ACACAGTTGAGGGGAATGCTGTCTGGTTCGAGACCATTCACCTGAAGAGCACGCATTCATCTTTTGAGTGATCTCGGACCAGGCTTCATTCCCCCCAACTCAA 2 0 3' arm Populus_trichocarpa pmrd mir-166 4e-47 ptc-MIR166g 9e-54 -53.3 ....(((((.((((((((..(((((((((((((.((((((...(((((...........))))))))))).)))))))))))))..)))))))).)))))... (-53.30)