mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAGCCAAGGACGACTTGCCCA GGAAGTCTCCTTGGCTATGCT GATGTTCGGTAGCCAAGGACGACTTGCCCACACTATGAGACAAGTGGTTAGAATTAGCAACTTCTTAATTGGTTATGGGAAGTCTCCTTGGCTATGCTGAC 0 4 5' arm Populus_trichocarpa pmrd MIR169_5 2e-51 ptc-MIR169ad 1e-52 -39.9 .....((((((((((((((.(((((.((((.(((((((((..(((.((((....)))).))))))))..))))..))))))))))))))))))..))))). (-39.90)