mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAGCCAAGGATGACTTGCCTA GGCAGTCTACTTTGGTTATC GAGGGTTTGGTAGCCAAGGATGACTTGCCTATTTCCTCCATAAGGCTTTAAAAAGCATGAAATGTGGTTTAGAGCTCAATTGAAGGGTTCATAGGCAGTCTACTTTGGTTATCCTAGCT 2 1 5' arm Populus_trichocarpa pmrd MIR169_5 5e-62 ptc-MIR169r 3e-63 -46.8 ...((((.(((((((((((..((((.((((((.((((.((...(((((((((..((((...))))..)))))))))....)).))))...))))))))))..)))))))))))..)))) (-46.80)