mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAGCCAAGGATGACTTGCCCA GGCAGTCATCTTGGCTATG CGTGTTTGGTAGCCAAGGATGACTTGCCCACTCCATTGAAAGAGTTTTTCAAGCATATGGTAGTGTAGAACTTTTCTTTGGTTCTGGGCAGTCATCTTGGCTATGCTGAC 0 2 5' arm Populus_trichocarpa pmrd MIR169_5 1e-56 ptc-MIR169v 6e-58 -44.1 ........(((((((((.((((((.(((((..(((..(((.(((((((....((((......))))))))))))))..)))...))))))))))))))))))))...... (-44.10)