mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAGCCAAGGATGACTTGCCCA GGCAGTCACCTTGGCTATG CGTGTTTGGTAGCCAAGGATGACTTGCCCACTCTATGGAAAGAGTTCTCAAGCACACGGCAGAGAGGACCCTTACTTCGGCTCTGGGCAGTCACCTTGGCTATGCTGAC 0 2 5' arm Populus_trichocarpa pmrd MIR169_5 4e-56 ptc-MIR169w 3e-57 -45.4 ........((((((((((.(((((.(((((..((..((.(((.((((((..((.....))...)))))).))).))..))...))))))))))))))))))))...... (-45.40)