mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAATACTGTCTGGTAATGCC CTTACCAGACATGGTTAGA TGCTGATGGATGTCTTACCAGACATGGTTAGATCTGGATGCATCTGTCTAATACTGTCTGGTAATGCCGTCCATCCAC TGGGTTCGGGGACCTGAGCCTGGTACACAGAATTGTGACGTCATCAGCTGTTTCCTAATTAAGAACAAGGAATCTCTATTCCTTCCCAATGGCTTTCCAGAATAGGAACTTTGCCCCAAACCAGAATCCAGGATTACTTCTTATCTTTCTTTACTTGGAGCCAGAGTACAGGGTCAGGGAGCCCCACCCAGTATCAGCCTAGATGACTCTTCCGGGGGAAGGAGTCTGTTCCTGGCTTTAATGTTACTCATTAAGCTGACAGCCATTCAGAAAACCAAAGAGGTGCTATGACGAGCATTTGCCAAGTAAGAGTGAGCAGATGACTCTCCTGTTGCACCCACAGACTTCCACACTTGAGGAACAGGCAACCAAGCTGGGCCCTGGTAAGAAAGTCCTTAGAGTAGTCCCAGGTCCTAGAAGGGTGAACCCCAAGAATGGCCCTTGGACCAGAGCAGGCAGGAAGCCAACCCTGGCCTTCCCTCTACAGGTATCAAATCCAACTGCCCAGATGGGGAGGCCCTTGTACTGCCCTGCTGATGGATGTCTTACCAGACATGGTTAGATCTGGATGCATCTGTCTAATACTGTCTGGTAATGCCGTCCATCCACGGGCCTTATCACCGCTGGAGACGACATCCTCACCACCTCGTGGACACTGGGTAGAGACAAGACCTTAATCCATCTGTTACAACTGTCCAGAGCTGGGTTCATCAAGCCCTCTATGCAAACAGACCACAGGTTAAATATACAGGCCCCGCTGAGCCTGACTGCCTTNCCTCTGACCCTGTAGTAGCTTTCGGNTACAGCCACAGCAGACTGAGGCCTCCGTATCCATCCTTTTTCAGAATAGTCAGTGGGGGCGGTCACAGTCCTCCTGGCCTCCATAGCCCACTGGGGCTCCCACGGAGAACTTCGATCTGGTCGGCAGCTGTCAC 4 0 3' arm Mus_musculus mirnest 100 mmu-mir-429 5e-39 -30.6 ....(((((((((.((((((((((..(((((((..(((....))))))))))..)))))))))).).))))))))... (-30.6)