mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ACTACTACATCATTGACGTTGAAC TTGGGGTTGATCCTTGTTTAGTTA TAATATGTTTGGGGTTGATCCTTGTTTAGTTATAATAGACCCACACCTGACTGCTTAGAATTATTTGTTATCGCATATCCGACTACATTATTGACGTTGAAAAACAGAGAACTACTACATCATTGACGTTGAACCATAAA 9 2 3' arm Populus_trichocarpa pmrd MIR480 1e-69 ptc-MIR480a 1e-75 -21.6 ...((((((..(.((..((...(((.(((((.((((((........((((....)))).......(((..(((......)))..)))))))))..(((....)))....)))))..)))..))..)).)..)).)))).. (-21.60)