mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AGGACCTCACTTAACAGCTTAAGC TTAAGCTATTGGGTTGAAATGATTCTTT ATCCTAGGACCTCACTTAACAGCTTAAGCTATTGGGTTGAGATGGTTCTTTGACATGATATCAGAGCCTTGATAACCAAGTGGTCTCGAGTTTGAATCTCATCATCCTCATTTATTTGATAAAAAATACTTAAAGGGGTGTGTTAGAGAATAATATAAATCATATTCTGGAACCTCACCTAACAGCTTAAGCTATTGGGTTGAAATGATTCTTTGACATT 2 4 5' arm Populus_trichocarpa pmrd 100 ptc-MIR481b 3e-123 -61.2 .((..((((.(((((((((.((((((((((.((((((.((...((((((..((.(((((...(((.(((((.....)))).).))).(((..(((......)))..)))..((((((..(((...((((((....)))))).)))..)))))).....))))).))..)))))))))))))).)))))))))).))))).)))...).))))..)).... (-61.20)