mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTCTGAACTCTCTCCCTCAA GAGGTGAGGGGTTCAGAACA CCAACTTCTTCTGAACTCTCTCCCTCAACCGCTACTCTAGAGCTTGGCAATCCTTGTCGATTGTTTCTGTGTAGCGGTTGAGGTGAGGGGTTCAGAACATGTTGG 0 2 5' arm Populus_trichocarpa pmrd MIR1446 1e-53 ptc-MIR1446a 6e-55 -58.5 (((((...((((((((((.((((((((((((((((.(..((((((((((.....))))))..))))..).))))))))))))).)))))))))))))...))))) (-58.50)