mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CAGAATTGCAGTGCCTTGATT TCAGGGCACTGCAATTCTAAA GAGGCCCTAATCAGGGCACTGCAATTCTAAATGTCTGTTGGCAAGTGGCGATGCCAGACGTTTGAAATTTACTTATCATTTATTAGTCAGAATTGCAGTGCCTTGATTTGGGCTTT 1 0 3' arm Populus_trichocarpa pmrd 100 ptc-MIR1447 2e-61 -54.4 (((((((.((((((((((((((((((((((((((((...((((........)))))))))))).......(((...........))).)))))))))))))))))))).))))))) (-54.40)