mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CTTTCCAACGCCTCCCATAC ATGGGAGGATTGGACAGTA GTTACGGGTATGGGAGGATTGGACAGTACTGCTTGGTTTTAATTAACCAAAGTCTGTTCTTTCCAACGCCTCCCATACCGGTAAT 2 1 3' arm Populus_trichocarpa pmrd 100 ptc-MIR1448 4e-43 -42.4 (((((.(((((((((((.(((((.((.((.((((((((......)))).))))..)).)).)))))..))))))))))).))))) (-42.40)