mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGAGGTGCACGTAAGATAACTC GTAAATAGTGCTTGCATTAAT GATTAGTTGAGGTGCACGTAAGATAACTCGATGTTAATTTAAAAAAACAAACAGGATCTCAATAAAATAAATTTAAAAAATACAGAAGGGTAAATAGTGCTTGCATTAATTAATC 4 3 5' arm Populus_trichocarpa pmrd 100 ptc-MIR1449 4e-16 -18.25 (((((((((..(((((.(((..((.((((..(((...((((((...........(....)...........))))))....)))...))))..))..))).)))))))))))))) (-18.25)