mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTCAATGGCTCGGTCAGGTTAC AGTCTGACCCGAGCCATTGAAGA GAGTCAATTAGGTCAGTTGTGTAGTCTGACCCGAGCCATTGAAGACAATCATTTGTTGGTGTCTCATTGGATTTGTTACCTGACAGTGTTTATCCAACAAATGATTCTCTTCAATGGCTCGGTCAGGTTACACAAGCAATCTAGTTGGCTC 2 1 3' arm Populus_trichocarpa pmrd 100 ptc-MIR1450 3e-82 -84.14 (((((((((((((...(((((((..((((((.(((((((((((((.(((((((((((((.....(((((..............))))).....))))))))))))).)))))))))))))))))))..)))))))...))))))))))))) (-84.14)