mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GATTTCGGACCAGGCTTCATTCC ATTGCTGTCTGGTTCGATGTCAT GTTGAGGGGATTGCTGTCTGGTTCGATGTCATTCATGTGAAGCTTTAACATTAATGTAGTATTGAGTGATTTCGGACCAGGCTTCATTCCCCCCAAC 4 0 3' arm Populus_trichocarpa pmrd mir-166 6e-49 ptc-MIR166b 3e-50 -45.8 ((((.(((((.((..(((((((((((.((((((((.(((..((.(((....))).))..))))))))))).)))))))))))..)).))))).)))) (-45.80)