mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGAGGTAGTAGTTTGTGCT CGCAAGCTACTGCCTTGCT CTCCCACACCATGGCCCTGGCTGAGGTAGTAGTTTGTGCTGTTGGTCGGGTTGTGACATTGCCCGCTGTGGAGATAACTGCGCAAGCTACTGCCTTGCTAGTGCTGGTGATGCTCAG GGGGAGCCTCCGCCCTGGGGCGCCCGGCGCGCGCTGCCGGCCGGCGGCGGAGAGGAGGACGAGGCGCCGCTGCGCTCCGCGTGGTCCGCCGGCTCCCACACCATGGCCCTGGCTGAGGTAGTAGTTTGTGCTGTTGGTCGGGTTGTGACATTGCCCGCTGTGGAGATAACTGCGCAAGCTACTGCCTTGCTAGTGCTGGTGATGCTCAGCGCCGCGGAGGACAATGGCCGGGGATCCCCTTTGTTTTCCGGGGCGCGGGGACCGCACGGCCGGCGCGGAAACCGTTAGCTCCCCGCATTCCCGCAGGGGCTGCGGGCCGAGGCGGCGGCCGCGGCGCCTTCCGGAGCCCGCGGGGAGAGCGAAGCCTTCGCGATTGCTCCCCGAGAGGAGCCGCGGCGGCCGCGGCACAACTTTCCGCCTGGAAGGGTTTTAACTCGTGCCGGGTTTTAGTTTGTCTGTTGTTGGGTTTCGTTCTCGAGGTGCGCGGCGGAGTGGGCGAGCGGCTCCGCGATGCACGACTGCGGTCGCGGTCAGAACAGTCAACGCTGGAATTCCAAACTTTTACGTCGTAACGTTTTAGGGGTCTGGGTTCTATAGGACCGCTTCGTTTAGAGTTTTAA 2 0 5' arm Mus_musculus mirnest let-7 2e-30 tgu-let-7i 2e-46 -46.8 ......((((..(((.(((((.(((((((((((((((((.((((..(((((.((...)).))))).........)))).)))))))))))))))))))))).)))))))........ (-46.8)