mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ACCACAGGGTAGAACCACGGA CGGTGGTTTTACCCTATGGTAG GTGTCTCTCTCTTGTGTTCCTGCCGGTGGTTTTACCCTATGGTAGGTTACGTCATGCTGTTCTACCACAGGGTAGAACCACGGACAGGATACTGGAGCACCCTC ACCACTGTGTGACCTTCAGCCTACAAAAGTTTACAGGCTCTTTGGCAAAAGCATTGTCCGTGGCACAACTACGAGCATGCAGTACGTCCTAGCAGTAGGTGACACGTGGGCTTCTTGGCTGTGGTGACCTCTCATCCTGCTGACCTTTTCGGTGTGGTGGCTAGTCTTCTGACTTATGTTGGAGCTCCCCGCCTCTGACCCTGCTTGCTGGTGGTGTATGTCTTACTGTGCTTGACCCTGCTTGCTGTTGGTGTAGTCTTCTGTGTTCAGTCCCAGTCCTGCAGATGACTTGTACTGTTCTACGTTGTGGACCTCTCCAGGCGTGTGCTCTGCGTTGGGCATCTGTGTGTGGCCTCCCGTCCTTCTGTGTCTCTCTCTTGTGTTCCTGCCGGTGGTTTTACCCTATGGTAGGTTACGTCATGCTGTTCTACCACAGGGTAGAACCACGGACAGGATACTGGAGCACCCTCTGCATCGAAGGACTCCATCTACACAGCCACAAAGCCCAGCAGCCAGGGGCTGGCCCCCCTTGACTACGATTCCCCGATTGTTCCCCAATTGCTCTAGCTCAAGCTCCTGAAGGACCCTGAATTCTGGCCTTGACGGCTTATATTGTAAGCGGCTGCAGCATAGCATCGCTACGGCCGTCTATTGGCGTGGGTGCTCGGTTCTGCACATACACTGGATCCCAAATCTCGCGTCTAGGCGTATTGCCTACCCGGCGTTCCTAGCGGTGCAGCCGCCAGGGAAACCCTACAACGTGAGTGTACCTATGGGGTTACCCTGAACGGGATGACCGCTGTATACACGCCAACTGAGCTCCACAACTTCTCCCGCTTCCCT 2 1 3' arm Mus_musculus mirnest mir-140 8e-30 rno-mir-140 3e-38 -44.5 (((.((((.....((((.(((((((.((((((((((((.(((((((..(((......)))))))))).))))))))))))))).)))))))).))))))).... (-44.5)