mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CTCAAAATGGAGGCCCTATCT AAAGTGCTTCCCTTTTGTGTG TGTTTGGATCCATATAGCCATACTCAAAATGGAGGCCCTATCTAAGCTTTTAAGTGGAAAGTGCTTCCCTTTTGTGTGTTGCCATGTGGAGAAAGCA TGTGGGTATGATTCAGTCTGTAATGGGGCAAAAGTAGAAGCTGAGGTGCACGGAACCTCACGGGAAGTGACCCAGATTTGACAGGTACTGTATTACATATAGCTGCATTTATCCTTTTGGCATTGAATAATCCTTAATCTTCAGTTCAGTTGTAGGCATGTTTGGATCCATATAGCCATACTCAAAATGGAGGCCCTATCTAAGCTTTTAAGTGGAAAGTGCTTCCCTTTTGTGTGTTGCCATGTGGAGAAAGCATCGGAACTTCAATCAACCAGAGACTCCTTGCTTGCTCATCTTGGTGAGACTCAAATGTGGGGCACACTTCTGGACTGTACATAGAAAGTGCTACTACTTTTGAGTCTCTCCTGTGGGCACCATTCACAGGTCTGCTACTTTCATGCATGTGTAGTGTGTATCTGAATCCAGATGAAGATTTCCTGGAACTGGGACATGTGGGTGCTATTGAAT 4 0 5' arm Mus_musculus mirnest mir-290 8e-39 mmu-mir-294 7e-42 -35.8 (((((...(((((((.((.((((.(((((.((((((.((.(((..(((....)))))).)).)))))).))))).)))).)).)))))))..))))) (-35.8)