mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AGATCATGTGGCAGTTTCAC GAAGCTGCCAACATGATCTGA CCGCTATTAGTTGAAGCTGCCAACATGATCTGAGCTTTCCTTAATTTTCCTATACAGGAAAGACTAGATCATGTGGCAGTTTCACCTATTGATGG 1 1 3' arm Populus_trichocarpa pmrd MIR167_1 1e-31 ptc-MIR167h 1e-46 -43.64 (((.((.(((.(((((((((((.(((((((((..(((((((..............)))))))..)))))))))))))))))))).))).)).))) (-43.64)