mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CGGACCAGGCTTCATTCCCC GGAATGTTGTCTGGCTCGAG TTGAGGGGAATGTTGTCTGGCTCGAGGACTTTTTGTTCATCAATCTAATCGAACTTTCTACCTGTAGATCTAGTATCTTATTTAAGATTGATCACGTATTAGGGTTGTCGGACCAGGCTTCATTCCCCCCAA 4 0 3' arm Populus_trichocarpa pmrd mir-166 1e-69 ptc-MIR166k 6e-71 -50.2 .((.((((((((..((((((..(((.((((((.(((..((((((((((..(((((.((((....))))...))).))....)).)))))))).)))....)))))).)))..))))))..)))))))).)). (-50.20)