mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AATCATACACGGTTGACCTAT AGGTTATCCGTGTTGCCTTCG TGCTTGAAGATAGGTTATCCGTGTTGCCTTCGCTTTATTCGTGACGAATCATACACGGTTGACCTATTTTTCAGT AGCCTATGTAGGGCGAGGGTCATTGGTGTTTGCCTCAATCTCAGTATGAAGCTAGGAACTTTCCACTCCTATGATGAACACAGGATGAAATCTGTGCATCTAGGACCTCCATCACCAGACCCTTGTAAGGACCCTTAGACACTGTATCCTTGGCAGTGGTGCCAAGACTAGATAACCATGGGTGTCAGGGGTTGGGGAGGAATGGGTTGGACCTGGGGTGCGTGATGCCTTCTCAAGCCCTCTCACAGTCAATGCAGTAACCTGCTGTGTTCACTGTGCTTGGGGGACTTCCTGGAGGAAGCCAGCTTCAGAGAAGAGATGCTGGTACCCACGTGCGGTGCTTGAAGATAGGTTATCCGTGTTGCCTTCGCTTTATTCGTGACGAATCATACACGGTTGACCTATTTTTCAGTA 5 0 3' arm Mus_musculus mirnest mir-154 5e-30 rno-mir-154 3e-37 -26.4 .(((.((((((((((((.((((((....((((..(((....)))))))....)))))).)))))))))))).))) (-26.4)