mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AAGTATTAAGCAAGTCTCGAT CGAGACATGCTTAATACTTAC GGGATTGGTATCGAGACATGCTTAATACTTACCAATGTTGCTAACTTACCAATCTCCATGTTTCCAAAACCATGATGAAGGCAAGTATTAAGCAAGTCTCGATATGTATCCC 1 0 3' arm Populus_trichocarpa pmrd snoR71 0.00000000003 100 -42.6 (((((..((((((((((.((((((((((((.((...((.....)).......((..((((..........))))..)).)).)))))))))))).))))))))))..))))) (-42.60)