mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCTCGATATGTATCCCAACATTG ATGTTGGGATTGGTATCGAGACA AATATTTTACCAATGTTGGGATTGGTATCGAGACATGCTTAATACTTACCAATGTTGCTAACTTACCAATCTCCATGTTTCCAAAACCATGATGAAGGCAAGTATTAAGCAAGTCTCGATATGTATCCCAACATTGATAAACTGTT 2 0 3' arm Populus_trichocarpa pmrd snoR71 2e-16 100 -57.1 ((((.((((.((((((((((((..((((((((((.((((((((((((.((...((.....)).......((..((((..........))))..)).)).)))))))))))).))))))))))..)))))))))))).)))).)))) (-57.10)