mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CGGGAACGTCGAGACTGGAGC TGCGGCTCGACTCACCGCGGA CTCTGCCCCGGGAACGTCGAGACTGGAGCGCCCGAGCCGAGCCACCTTCGCCGACCCGGAGCGCTGCGGCTCGACTCACCGCGGAGGCGC CTCTGCCCCGGGAACGTCGAGACTGGAGCGCCCGAGCCGAGCCACCTTCGCCGACCCGGAGCGCTGCGGCTCGACTCACCGCGGAGGCGCTCGGACGCGAGAAGCGATTTCTGCTGCCTGGGGCCGTGGCGGTGGGGGCTGCGGAGCCCAGGAGCTTCCCACCCAGAGGAAAGGCAGCCTCACCCTCACTCTTCTCAGCGCGGACACGCCGCCCTCACCGCCGTGGGTGAGGGTCCTCAGGCTACACCCCACGGCTTGGAATTCCACAACATTGGACGAGGCACTCAGGACGGCCTGGCTCCCACAGACCCCTGCAGGTGAGGACAGATGCAAAGTGTGGGCGGGACTGGTTCTTGGGACGCAGACCCCGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGCAGCGGCGGTGGCGTGGTGATTCTCCCTCCGCACACCCCGGTGGTGGTGGTGGTGGCAGCGGCGGTGGCGTGGTGATTCTCCCTCCGGTGCTCTGTCCCTCCCTTCCCTCTCCTAACCCCTCTTTCCTCTCGAGCAGCCTCTGCCCCCCTCCCCAGGGCTGAGCCTCACTTACCTTCCACCTGGCCTCTCCTACCAGCTTTTGCATCCTGTCCTGACCTGTCCTTGCCTCAGGCCAAGACCCCCCGCT 4 2 5' arm Sus_scrofa mirnest 100 hsa-mir-1247 8e-17 -35.7 ...(((((((((...((((((.(((.((((((((...((.((.......))))...))).))))).)))))))))...)).))).)))). (-35.7)