mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTGAGTTTGGCTCCACCACCA GTTGGTGTCGCTAGACTCAATT TGGGTCTGGTTGGTGTCGCTAGACTCAATTGCCTTGCCCACCAGACTGAAGGATATGGGGTCTGGCTCCACAGCAAGACCTAATTGCATTTGAGTTTGGCTCCACCACCATACCCA 2 1 3' arm Populus_trichocarpa pmrd MIR474 0.00003 100 -53.1 .((((.((((.((((..(((((((((((.(((........((........)).....((((((.(((....))).))))))....))).)))))))))))..)))))))).)))). (-53.10)