mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CTCGAGCCAGACAACATTCCC GAATGAAGCCTGGTCCGACGA TTGGGGGGAATGAAGCCTGGTCCGACGACCCTAACACATGATCTAAGATATTAGATCTAAAGATAGAACACTTGATCAGACTGATCAAGAAAGAGTCCTCGAGCCAGACAACATTCCCCTCAA 6 0 3' arm Populus_trichocarpa pmrd mir-166 2e-64 ptc-MIR166c 1e-65 -52.9 .(((((((((((..(.((((..(((.(((.((.......(((((((....))))))).............(((((((.....)))))))..)).))).)))..)))).)..))))))))))). (-52.90)