mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ACCTGTCATATCGAATGTTTA AAGATTTGATCTGACAGCACT TTCCTCCCCGTTAAATTTTAGACCTGTCATATCGAATGTTTAGATACTAATTAGACGTACTAAATATAGATTAATGATAAAACCCATTCCATAACCCTAGCGTTAAATGACGAGACGAATTTTTTAAGCCTAATTAGACTATGATTAGATAATGTGGTGCTACAGTAAACATCTTCTAATGATAGCTTAATTAGGCTTAATAGAATCGTCTTGCGAATTACTATCCAACTATGTAATTATTTTTGTATTTAATTTATGTTTAATTATACTATTTAGCAAATAAAGATTTGATCTGACAGCACTAAATTTTAGCCCCAAAGA GGGGACTCAAGTCGGTGCTGCGGATTTGGGTGCGAAGATGGGACTGTTGTCTGCTGGGTTCGAGTTGTCGGGCGTCTACTTTGAACATGTGGTTCGGAGTAGGCTTGGCTGGTGAACGGCGTTCGCACCTTACCATTTGGCTTTGCGAGTCGAGCTACACACTTGACCATTTGGCTTCATGCTCGCAATCACGGCCATCCGTAGCACAGAGGCACTTGGCTCAATGAGCACGTGCTGACTGGTGAACCAGTGGGTGTCTGAGCTTGGAAGCTGAGTTACGCGTGTACCTCAGGGGCTGTTCGGTTCCTCCCCGTTAAATTTTAGACCTGTCATATCGAATGTTTAGATACTAATTAGACGTACTAAATATAGATTAATGATAAAACCCATTCCATAACCCTAGCGTTAAATGACGAGACGAATTTTTTAAGCCTAATTAGACTATGATTAGATAATGTGGTGCTACAGTAAACATCTTCTAATGATAGCTTAATTAGGCTTAATAGAATCGTCTTGCGAATTACTATCCAACTATGTAATTATTTTTGTATTTAATTTATGTTTAATTATACTATTTAGCAAATAAAGATTTGATCTGACAGCACTAAATTTTAGCCCCAAAGAAACGAACACCCCCTCGGCTGGCTGGAGCGGGGGGCCTTGTTT 4 0 5' arm Cynodon_dactylon mirnest 100 osa-MIR2124a 5e-18 -81.3 .........((((((.(((((..((((((.(((((((.((((....((((.(((......((((((((((((((..((((((..((((...((((......)))))))).((((((((.(((.((((((((((((((.((((.((((((..((((..(((....))).))))..)))))).)))).)))))))))))))).))).))))))))..((((((...........))))))..))))))..))))))))))))))......))).))))....)))).))))))).))))))..))))).))))))........ (-81.3)