mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GTATTAAGCATGTCTCGATACC TATCGAGACTTGCTTAATACTT TGTTGGGATACATATCGAGACTTGCTTAATACTTGCCTTCATCATGGTTTTGGAAACATGGAGATTGGTAAGTTAGCAACATTGGTAAGTATTAAGCATGTCTCGATACCAATCCCAACA 3 0 3' arm Populus_trichocarpa pmrd snoR71 0.0000000000001 100 -54 .((((((((...(((((((((.(((((((((((((((.((..((((..........))))..))...((......))......))))))))))))))).)))))))))...)))))))). (-54.00)