mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ATATTGGGACCTCACCTAAT TAGGTGATGTCTCAATATAT TATAAATCATATATTGGGACCTCACCTAATAGTTTAAGCTCTTGTAAATCATATATTGGGACCTCACATAATAGCTTAAGCCAAGAGCTTAAGCTATTAGGTGATGTCTCAATATATTATTTATA 1 0 5' arm Populus_trichocarpa pmrd 100 ptc-MIR481b 0.0004 -56.93 (((((((.((((((((((((.(((((((((((((((((((((((.........(((((.(....)...)))))........))))))))))))))))))))))).)))))))))))).))))))) (-56.93)