mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ATCAATGGCCATTGTAAGAGT TCTTACAGTGCCCATTGATTA CATCTTGATCAATGGCCATTGTAAGAGTAGAAGGATCCATGAAGCAATAACTCTCTTTGCTAAAATGTGTGATAAAACATTGACTCCTGGTATTTCACTCTTACAGTGCCCATTGATTAAGATG 1 0 5' arm Populus_trichocarpa pmrd MIR475 4e-38 ptc-MIR475a 3e-66 -51.6 (((((((((((((((.((((((((((((.((((...(((.(((((((.........)))))..(((((........)))))...)).)))..)))))))))))))))).))))))))))))))) (-51.60)