mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GTTGAGATGGTTCTTTGACA TCAAAGAACCATCTCAACCT AAGTTATTAAGTTGAGATGGTTCTTTGACATGGTATCAAAGCCTTGATAATTAGATAAACATGCATGTGATGATGGGTAAGAGATTCGAACTTGTGACCGCTTTGTCATTAAAGCTCTGATACCATGTCAAAGAACCATCTCAACCTAATAGCTT 0 0 5' arm Populus_trichocarpa pmrd 100 ptc-MIR481e 4e-20 -71.01 (((((((((.((((((((((((((((((((((((((((.(((.(((((.....((((((.......(((.(.(..(((..(.....)..)))..).).)))))))))))))).))).)))))))))))))))))))))))))))).))))))))) (-71.01)