mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GAGCATCATCAAGATTCACA AGAATCTTGATGATGCTGCA TTGCGGGTGGAGCATCATCAAGATTCACATGCAAATGCACGGCCGGTGATGTTAAGAGTTAAATCTTTCTTTGTTTCTGTTCATCTGCCAAAGTTCTTTGGAAGTGAGAATCTTGATGATGCTGCATCGGCAA 2 0 5' arm Populus_trichocarpa pmrd mir-172 3e-70 ptc-MIR172b 1e-71 -55.2 .(((.((((.((((((((((((((((.(((.((((.((..(((.(((((.....((((.((((......)))).))))..))))).)))...))..))))...))).)))))))))))))))).)))).))). (-55.20)