mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTTAACATGTATGTGCCTTCAT GAAGGCGCATGCATGTTGGAAT TTGCATGATCTTTAACATGTATGTGCCTTCATTTTGATCAAATCTGACCAGCAACCTGGGTTCCAAATCAAACCATATTTTTTTAAAACGAAGGCGCATGCATGTTGGAATTCATGCAA 1 0 5' arm Populus_trichocarpa pmrd 100 100 -49.36 .(((((((..((((((((((((((((((((.((((((..((((.((.((((....))))..............)).))))..)))))).))))))))))))))))))))..))))))). (-49.36)