mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTGAATAAGACGAATGATCAA GATCCTTCGTCTTATTTAAAA TAGTATGTGTTACTCCCTCCGTCCGAAAATATAAGCATTTATTGATTTTTAGATATCATTTTTGATCCTTCGTCTTATTTAAAAAATTTGTAAAATATAAAATTAAATAAGTCATATTTAAAGTATATCTAATGATAAAGTTGACTATAATAAAATTAATAATAATTTTATAACTATTTTGAATAAGACGAATGATCAAACATAAAATTCAAAAGTCAACAAATACTTATATTTCTGGACAAAGGGAGTACTCTGCTCG GGGGATTTCATCGGGTTCCTTTGCCTCTGTGCCTTCTCCAATGCCAAGCATATCAAAGTCGGCTTTCAAGATGGAAAGCCGTGTCCCTGCCGCTTGTCCAAGGTGGAGAAGAAGTCCATCCAGTACACGCCACCGCCGGTACTTCTACATCAAACTTTCGGCCTGAGAGGTTTCCCTCTGCAGCTTCCTTCCTACCCTGGTACCGACAACTACATCGGCCAGGAACTCGCCGGAAACACCATCGCTGGCAGCTGCTCGGAATCGACCTAACATGTGAGTTCGAGTACAGTCACCTTCAGTGTCTGGCTGTGCATGTCTTGCCATCTAAAGGTGTCATTCTGCCTTTAATCAGCGTCCGGGTGAACAACATACACATCAAGCTTCACGGACGATTTTCCATCAAGCAGGCAGTAAGACCCTTGACCAAACCTACTCTAATGCAGCGAGGCCCTTCGGCAGAACTTTGTCAGTCTGCCTGTCTACGGCTTGTCTTAGTATGTGTTACTCCCTCCGTCCGAAAATATAAGCATTTATTGATTTTTAGATATCATTTTTGATCCTTCGTCTTATTTAAAAAATTTGTAAAATATAAAATTAAATAAGTCATATTTAAAGTATATCTAATGATAAAGTTGACTATAATAAAATTAATAATAATTTTATAACTATTTTGAATAAGACGAATGATCAAACATAAAATTCAAAAGTCAACAAATACTTATATTTCTGGACAAAGGGAGTACTCTGCTCGTTGGGAGCGTTCATGTATGCACCTGCTC 1 0 3' arm Cynodon_dactylon mirnest MIR812 0.00000000000007 osa-MIR1884a 0.0000009 -68.8 .((((...((.(((((((..(((((.(((((((((.((((.(((((((((.(((...((.(((((((.((((((((((((((((...(((((((((.....(((((...(((((..((((...(((.....))).))))..))))).........)))))....)))))))))...)))))))))))))))).))))))).))...))).))))))))).)))).))))))))).)))))..)))))))))..)))).. (-68.8)