mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ACAGCAGGCACAGACAGGCAG GCCTGTCTACACTTGCTGTGC GGCTGGACGGAGTTGTCATGTGTCTGCCTGTCTACACTTGCTGTGCAGAACATCCGCTCACCTGTACAGCAGGCACAGACAGGCAGTCACATGACAACCCAGCCTGAA TAGTGGATCCCCCGGGCTGCAGGAATTGGGCACGAGGTTTTTTTTTTTTTTGGTTGTTTTTTCCTTAACATTTCAATGTGAGTTTTCTGTTATGTCAATTATCCATGTTAGTACATTGGAACAAATGTATAAGTGTACTTTCTGAATAAAGTTAAAAGTCTAACTTGTTTTTAGTTCTATAATGTTTTAATGTTTAATTCTATTGTGTGTTTTTCTCCCTTTCCCCTGACCCTCCAAAATCACCAAATCTGGAAAACAGACTGATTGTATCTGCCCATGACCAAAGGAAACCCGAAGGAACCAAGGGCCTGGCTGGACGGAGTTGTCATGTGTCTGCCTGTCTACACTTGCTGTGCAGAACATCCGCTCACCTGTACAGCAGGCACAGACAGGCAGTCACATGACAACCCAGCCTGAAAGACAACCAGCCATTGAAAGAAAGCAGCCCTCACACCATAGCATCTACACCAAGAGCTACAACCAAAATGAGGGATGTGGGGGCCTGGGGTTTTAATCTGTTGGTTTCTTAACTCGTATGTATTATTATTATTATTTTCTTTTGATTCAAATATTGAAACCCACCAAAAGTAAAGTGAGTGGTGCTTATGAAATATAATAAAACCCATTTCTGAAAAAAAAAA 3 0 3' arm Sus_scrofa mirnest mir-214 6e-49 cfa-mir-214 6e-55 -57.4 ((((((.....(((((((((((.((((((((((...((((((((((((.............))))))))))))...)))))))))).))))))))))))))))).... (-57.4)