mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AGACCCAAGAGCTTTGGGTTTG GACCCAAAGAGCTTGGATCTCG TACGCCAGACCCAAGAGCTTTGGGTTTGCGATCATGTCAAATCTAAGGACCTTGGGTCTGACGTGGTATCCAGACCCAAAGAGCTTGGATCTCGCGTG 3 0 5' arm Populus_trichocarpa pmrd MIR474 0.00002 100 -53.5 (((((.(((.(((((..(((((((((((..(((((((((.(((((((...))))))).)))))))))...)))))))))))..))))).))).))))) (-53.50)