mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGGAGAAGCAGGGCACGTGCA CATGTGCCCATCTTCTCCACC GATAAGAGAGATAGATGGTGGCTGTGCATGGTGGAGAAGCAGGGCACGTGCATTACCATCCAATGCCGCTGGTCATGCTCCTGCTCTACCTCCTCCCTCTGAGTTCTGAGCTTACCATGGGATCCGGATGGACGGATGGTTCTTCATGTGCCCATCTTCTCCACCGAGCACAAACTGTCTCAATAAACCTCAT CCGGGGGAGAGTGGCTATATCAAATCCAATTCCTTCGCAACTCCTCGCAATAGAGATTATAGATAAGAGAGATAGATGGTGGCTGTGCATGGTGGAGAAGCAGGGCACGTGCATTACCATCCAATGCCGCTGGTCATGCTCCTGCTCTACCTCCTCCCTCTGAGTTCTGAGCTTACCATGGGATCCGGATGGACGGATGGTTCTTCATGTGCCCATCTTCTCCACCGAGCACAAACTGTCTCAATAAACCTCATACTATCACCAGGTGCCCTCACCGGTCTCTCATCTCGCTGGGCCATCTGTTTGTGTTTTTCTCATCGCCGGTCAGTGGTTCTCACTTTTATGTTTTATCTATGGTTGTAGTTTTGATGTTCTCCTGTGTCTCCGTATCTCTCCTCTTTCCATGATTATGGTTACTTTATGATGTTCAGCAACGTTGTTTAAGATCATGAGTTAAGTTTTCTTTCAGGAGAGGTAATTGAACAGCAGGACCAACAAGCGGTAGAACCAGACAACTCTTTGCTTTGATTAAGCTGTTTACCGGCACTAACTCTTTGGCTGTAGCAGCTCCTAATTAAATGTTGCAACATCCTTTTCGCAGAGCGGAAATGCCCGTGATTACTGGGTAAACACACTGTACTGTTGTCATTGATGCATAATTATCGGCTGACATGATACAGCTTAACTCCCACAAGCACTTATCCTCCAAAGTCAAGAGCTTGCGATTGTCATGCTATTCTTCTCTTCGACTA 4 0 5' arm Cynodon_dactylon mirnest MIR164 9e-19 zma-MIR164b 8e-22 -73 .....(((..(((((((((...(((((.(((((((((((..(((((((((....(((((((....(((.((((...((((..((((..............))))...))))..)))))))..(((....))).)))))))....)))))))))..))))))))))).))))).)))))))..))....))).. (-73)