mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CTTGGCAGCCAGACCCAACA TTGGGTCCTGCTGCCCAGCA TGGGTCCAGCTTGGCAGCCAGACCCAACACGGGCCCAAAACACTTCCAAAAGGAGCCAGTAGAGTTGGGTCCTGCTGCCCAGCAGCACCCA 4 0 5' arm Populus_trichocarpa pmrd MIR474 2e-45 100 -44.76 .((((.(.(((.((((((..((((((((.(.(((((...............)).)))....).))))))))..)))))).))).).)))). (-44.76)