mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ATTTACCAACGGAATTACCGACGGA CGTCGGTAAATCCGTTGGTAACCTT GTGTCAGGATTTACCAACGGAATTACCGACGGAATTTATTCCGTCGGTAAAATCCGTCGGTAAATCCGTTGGTAACCTTGTTTACAC 3 0 5' arm Populus_trichocarpa pmrd 100 100 -44.6 (((.((((..(((((((((((.(((((((((((.((((((.....)))))).))))))))))).))))))))))).))))..))).. (-44.60)