mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGGAGAAGCAGGGCACGTGCT CATGTGCCCTTCTTCTCCATC GTGGAGGATGGCGAGGTGCGCGAGGTGGAGAAGCAGGGCACGTGCTTGCTTGCTTGCCCCTTCTCTAGCCGGTTTAGCATTCCGGCCGGCCGGCAGCGATCGAGCGAAAGGCTTGGTCGCCGGCCGTCAGGCTTGCTAGCTCATGGAGCCAGCTGATGCATGTGCCCTTCTTCTCCATCGTGCATGCCTCGCCTGCGCATC AGCCAGATCGACTGCACTGTTGAGAGATGAGAGACAGGCGTATTTCTGCCATGTAGCGGCAGCAGACTACAGGGGTACGCGTGGTCTTTAAATTAACCGGTCTTCAAAGCCTTATATAACAGGTGGCTGGTGTGGAAGACGACCAAGAGGACTATGGGAGAAGAGGCACAGTACATATGGTCGCCGTCTCCCGTCTCCGGCATGGAAGCTCTTGTGTCCCAGTGGAGGATGGCGAGGTGCGCGAGGTGGAGAAGCAGGGCACGTGCTTGCTTGCTTGCCCCTTCTCTAGCCGGTTTAGCATTCCGGCCGGCCGGCAGCGATCGAGCGAAAGGCTTGGTCGCCGGCCGTCAGGCTTGCTAGCTCATGGAGCCAGCTGATGCATGTGCCCTTCTTCTCCATCGTGCATGCCTCGCCTGCGCATCTTTTGTACATGTGCATGTAAGAAAGGTAACTCTTGAACTTCGATCGGGTTCCACGCTCGTCTTCAGAGGGTTTATTTGGACGAAGCAGCAGGATATGAGTGCTCTATCGGCTTGATCATCATATCAATATTGCTTCTCTATTTTACTCAACATATTTTTGATGATTTTATGAGGTTCACATACATGTGGCAGCGGTGTGTTGGCAAGTACTAGAATCACACTGTTACCTTCATATTTCTTTTTTATATATTATTATTTTCTTTTATTGATATAATAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACATGTCGGCCGCCTCGGCCCA 2 0 5' arm Cynodon_dactylon mirnest MIR164 1.0E-8 osa-MIR164f 1.0E-14 -98.6 (((......(((((((((.(((.((((((((((.(((((((((((......(((.((.((....(((((.(((((.((......))((((((((...((((((((.....))))))))))))))))..))))).))))).....)).)).)))....))))))))))).)))))))))).))).)))))))))..)))... (-98.6)