mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTTATTGAGCACCTACTATAT ATAGCTGTGTCAGTGAATA TTAATTCAAGATTTATTGAGCACCTACTATATGCCAAGCACTGTTTTAGGCTCTTGGGATAGCTGTGTCAGTGAATAAAACCAAT AAAATATTAATTCAAGATTTATTGAGCACCTACTATATGCCAAGCACTGTTTTAGGCTCTTGGGATAGCTGTGTCAGTGAATAAAACCAATAAATATTCCCACCTTTAGAGAACTTATGTTCTAATGGAAAAAGACAGACAATAGACATAATGAGTAAATTACATAGTCTGTTAAAATTGTGTATAATTGCTATAGAAAAAGATGGGGAAGGATAAAGGAGGGTTGTAGTTGCAATTTCAAGAGGGGCAGTCAGATGAGGCTTCTTTGAAAAGGTGGTTAGATGAGAAGGGAGTATATAAAGTGCTATCAGAAATGAAAAGAGTAGGGACTTCCCTGGCAGTCCAGTGGTTCAGACTTTGCCTTCCAGTGGAGGGGGTGCAAGTTTGATCCCTGGTTGGGGAGCTAAGATTCCACATGCCTTCCAGCTGAAAAGCCAAAACATAAAACAGAAGCAATATGGTAACATTCAATAAAGACTTTTAAAATAGTCCACATCAAAAACAAACTTTATTTTTTTAAAGAAATGAAAAGAGCTAATTTAGGCTGGGCTTCCCAGGTGGCTCAGTGGTAAAGAATCTGCCTACCAATGCAGGAGACATAGGTTTGATCTCTGGGTTAGGAACATCCCCTGGAGAAGGAAATAAACCCACTCCACTATTTTTGCCTGGGAAATCCTGTGGACAGAGGAGCCTGGTGGGCTACAGTCTATGGGATCACAAAAAGTTCAGACACAGTTTAGAGATTTAAACAGGGAAGCAATTTTAGGGCTG 4 2 5' arm Bos_taurus mirnest SNORA7 0.0003 100 -16.4 ..........(((((((((.(((...((((...(((((..((......))..))))).))))..))))))))))))......... (-16.4)