mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AAAAAGTTTGTTTGGGTTTTT TAACCTGGATGAACTTTTTGG TGGGGTTGGCCAAAAAGTTTGTTTGGGTTTTTCCATCGCATCTTACAGGCTAACCTGGATGAACTTTTTGGCTCAACCA GGCACGAGGGTCTTCCTCACCTAGGTCATTTGAGCCCTTTTGCTATTACAGCCTTGAGAAATTACAGGTTGAGAGTCACCACAGCACTGAGAGAGGGACTTGTGTATCTGTGCCTGGCGCTCAGCCTCCAGACAGGCTCACCTGACAAGGAAAAGTGGGTTTTTCGGTAGTTGTAGGATTTCAGACTGACTCAAGATATCAGACCACCCCAGTCAAATCTCTATTTTAACCCTGAGTATGCTATGGGGTTGGCCAAAAAGTTTGTTTGGGTTTTTCCATCGCATCTTACAGGCTAACCTGGATGAACTTTTTGGCTCAACCACTATACATTTATGAATGGTCATTCCAAAGGGTCCAGAGGGGCTTAACATCGCACTGAAATCAGCAATGCTGCTC 3 0 5' arm Bos_taurus mirnest 100 bta-mir-2284f 0.0009 -33.2 ...((((((((((((((((((((((((((...((.............))..))))))))))))))))))))).))))). (-33.2)