mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GAGCTATGATGACTTTGATTGCAT GTATGCAGGGTTATTATAATTAA TCTGAAAATGTATGCAGGGTTATTATAATTAAAAAGGTGAGCTATGATGACTTTGATTGCATTGATCA GTGCGAGCGCCTTACAGCTTCCGTTCTGAGGATCGGCTGTCCTCCCGCGTGCCGAGCTGCTAGGAAGCCGCTGTTGGCGAGCTCGCAGGAGCTTGAGACCGTCGTCACCTCTCCAATTTTAACCAGGGGGGGAAAATGGTTGAGGCAGATCGCCCAGGAAAGCTCTTTATCGGTGGCCTCAATACAGAAACCAATGAGAAAGCCCTTGAAGCAGTATTTGGCAAATATGGACGAATAGTGGAAGGTGAGTTATCTGAAAATGTATGCAGGGTTATTATAATTAAAAAGGTGAGCTATGATGACTTTGATTGCATTGATCACATGAAATGATAATGTGCTTTGTCCTCTAAGAAGTTCTGAGCTTGCTTTCTTTTTTACAGATTAATTTTTGTTTTTCCTTTTCAACTAGAGTAACACTTTTTTCCCCCTGAAAACTACTTTTTAGTTCTCTTGATGAAAGATCGTGAAACCAACAAATCTAGAGGATTTGCTTTTGTCACCTTTGAAAGCCCAGCAGATGCTAAGGATGCAGCCAGAGACATGAATGGAAAGGT 3 1 3' arm Bos_taurus mirnest SNORD61 0.00000006 bta-mir-2484 4e-33 -18.4 ..(((.((((((..(((((((((((((.(((......)))..)))))))))))))..))))))..))) (-18.4)