mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GTGGGTGGAATAGTATAACAAT TGTTATAGTATCCCACCTACCC GCATCGCTACACCTAAAGGATCCTCATTAGGGTGGGTGGAATAGTATAACAATATGCTAAATGTTGTTATAGTATCCCACCTACCCTGATGTGTCTTTAAGACTCTCTCACGGT GTCTGGCTCCACCAAGGAATTTTTCAGGAGATCTAAAATTGCAGTGTTTGATAAAATGTGGACCTACATGAGAAGTGCAGAACCCTCAGTGTTTGTGAGGACTACAGCTGAAGGGGTGGCCAGAGTGCGGAAGTCCAAAGGGAAATATGCCTACTTGCTGGAGTCCACCATGAACGAATACATCGAGCAAAGGAAGCCTTGTGACACCATGAAAGTTGGTGGGAACCTGGATTCCAAAGGCTATGGCATCGCTACACCTAAAGGATCCTCATTAGGGTGGGTGGAATAGTATAACAATATGCTAAATGTTGTTATAGTATCCCACCTACCCTGATGTGTCTTTAAGACTCTCTCACGGTTTGTATGTGGATATGAGGTAACTCACCATCACAGAAATGACCAAAAACATTTCTGAATGTTTTTAAACATTTACACACTGTTTTCTATTGATGACAGAGTTTGGTTTTGTTTATGG 2 0 5' arm Bos_taurus mirnest 100 rno-mir-2985 9e-45 -43.3 ((...)).....((.((((((...(((((((((((((((.(((.(((((((((((.....))))))))))).))).))))))))))))))).)))))).))............. (-43.3)