mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTGGGAACATTTTGCATTCAT TTTTGCGATGTGTTCCTAATA CAAAGAAAGATGCTAAACTATTTTTGCGATGTGTTCCTAATATGTAATCTAAATGTATTGGGAACATTTTGCATTCATAGTTTTGTATCAATCTTC GGCTTCTTTCATTTAGCACAATGTCCTCAAGGTTCATCCATGTTGTATACATGTCAGAAGTCCCTCATTTCAGTATTTTTAAGAATAGAAATTAGAAAAATCTTGATGACCAATGAAAAAGGATTGGGTAAATAAAAGATGGTGCCTCTAATATGTGGCAAGAGAATATGCTCCTGCTGAAGTATTTAGCAATAAAACAAATGAGCAAATTTTTGCACCTCTCCCATCTATGCAATCTGAGCGTACAGGGGGCATTCTGTATGTAGTTTTGTTTCAATATACAGATAAAAGGCTGGGAGGAAATGTATCAAAACTTTTAAAGTGGTTATCTATGAATTGTGGTATAAAAAGTGTTCAAAGAAAGATGCTAAACTATTTTTGCGATGTGTTCCTAATATGTAATCTAAATGTATTGGGAACATTTTGCATTCATAGTTTTGTATCAATCTTCATATTATTATATGGAAAGAAGGCTAGGAGGACGGATACCAAAAGTCCATCAAAGAAAGATGCTAAACTATTTTTGCGATGTGTTCCTAATATGCAGTATAAATATATTGGGAG 4 0 3' arm Bos_taurus mirnest mir-450 1e-31 bta-mir-450 3e-47 -34.6 ..((((..(((((.(((((((...(((((.(((((((((((((((.......))))))))))))))).)))))...))))))).)))))..)))). (-34.6)