mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GTGTGCGGAAATGCTTCTGC GGAAACACTTCTGCACAGGC AAAGAGTACTCTATGAATCTAGTGGAAACACTTCTGCACAGGCTAGATTATGGATACCAGTGTGCGGAAATGCTTCTGCTACATTTTTAGGGCCTGCCT TTGAGGTCCCTCTGGATCCCCCAGATTTGGATTCTACTCTTAAGTCATCATGGGCTTTTTCCAACTCCTGATGAAAAAGAAGGAACTTATTCCTTTGGTGTTTTTCATGACCGTGGCAGCTGCTGGAGCTTCGTCATTCGCTGTGTATTCCCTTCGAAAATCCGATGTGATCCTTGATCGAAAAAGAAATCCAGAACCTTGGGAAACTGTGGATCCTACTGTACCTACAAAGCTTGTAACAATCAACAAGAATGGAAGCCCATTGAAGAGTTGCAGAAGGTCCGAAGGGCAACCAGGTGACCAGTCCTCGCCTTTTTCTTCCAAAGAGTACTCTATGAATCTAGTGGAAACACTTCTGCACAGGCTAGATTATGGATACCAGTGTGCGGAAATGCTTCTGCTACATTTTTAGGGCCTGCCTACGTTTTTGGACTCTGGATAAGGAATTATAAAGGTAGCACAGCATAACCACATAGTCCCAAAATAAGACTCTGTGTTGTTTTGTGTACAATTTGTGCAAGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 3 0 3' arm Bos_taurus mirnest mir-147 7e-21 bta-mir-147 5e-40 -30.2 ........(((((.((((.((((((((.((.((((((((((((((.....)))...))..))))))))).)).)))))))).)))).)))))....... (-30.2)