mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GAACTAAACATTGGTGAAGAA CTTCACCAATGTTTAGTTCTC ATGACCATCCGACTTCTTCACCAATGTTTAGTTCTCTTTCAACCTTGTGCCTCTTCTTCATCATCTCGATAGTCATGGGAGTGAAGAAGAGGCACAAGGTTGAAAGAGAACTAAACATTGGTGAAGAAGTCGGATGGTCAAAGAACA ATGACCATCCGACTTCTTCACCAATGTTTAGTTCTCTTTCAACCTTGTGCCTCTTCTTCATCATCTCGATAGTCATGGGAGTGAAGAAGAGGCACAAGGTTGAAAGAGAACTAAACATTGGTGAAGAAGTCGGATGGTCAAAGAACATGGAAGCTGCAAAGACTAACCCTAAACTTGCCGGAATGAACAAGAAGTTCGGTATGATCCACGGGCTATCATCTCTTGCCAATATCTTGTC 0 0 3' arm Dioscorea_alata mirnest 100 100 -106.7 .((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((..(((((.......)))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))....... (-106.7)