mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TACATACACACATACACGTGC GTGTGTGTGTGTGTATGTGGG ATGTAAATGTATACATACACACATACACGTGCAAGTGTGTGTGTGTGTATGTGGGTATAACAC TTTTTGTTCAGAAGCCCACGAAGGTTTATTTTTTATATAATCACATAGCATATACTGTATATTTTCAACATGAGATTGGACAGTAATAAATGCTTGGTATATTTCTGTGCAGATAAATACAAGTAGGCCTATGTAAATGTATACATACACACATACACGTGCAAGTGTGTGTGTGTGTATGTGGGTATAACACACATGTTGTTTGGCCCATCGAAAAACCAGACACGAAGTATCCATAATACATTAGCCACAATACTCAAAGATATGAGCACTGGATATGACACTTAGAAACATATGGCTCAGATACCTGCAATGATTTTTTTAAATTTCAGTAAGATTTTGGGAAAACATCCTATTTCTTACCTACATTTCCAGTCATTAAGTATGAATTCTGAAAGTCCATCATCCCCATTCCAACAATGTGTATAAAATCTTCAATCACCTGCATTAACTCTATCGAGCCTGGATAAATCTGCTGTGCATCTTCCCATTTTTCCTTGTTGTCTTCATCGAGAAGGTTGCTAACTATTTGAAAGAAGTTCTGGACGCCATCAGAGGCAGGGATGTAACTTGCCCTTTTAAAGGTGTTGGTCACATTCCTGAGGATTTCAACCGAC 2 0 5' arm Bos_taurus mirnest 100 mmu-mir-466m 0.0007 -26.7 .((((......(((((((((((((((((((....)))))))))))))))))))..)))).... (-26.7)